QAZIIM жүйелік биология & биоинформатика бөлімі

Жүйелік биология & биоинформатика

QAZIIM-нің есептеу биологиясы мен цифрлық денсаулық сақтау орталығы: мультиомика, клиникалық геномика нәтижелерін интерпретациялау, ЖИ қолдайтын аналитика, регистрлер және қауіпсіз деректер жүйелері.

Есептеу биологиясының клиникалық орталығы

Орталық геномика, мультиомика, жасанды интеллект және қауіпсіз медициналық деректерді клиникалық және зерттеу шешімдеріне біріктіреді.

QAZIIM көпомикалы талдауының өзегі

QAZIIM құрамындағы Жүйелік биология & биоинформатика бөлімі геномика, транскриптомика, эпигеномика, протеомика, метаболомика және клиникалық деректерді бір талдау жүйесіне біріктіретін негізгі есептеу орталығы ретінде дамып келеді. Бөлім зертханалық өлшемдерді дәрігерлер мен зерттеушілер қолдана алатын түсінікті, тексерілетін интерпретацияға айналдырады.

Генетиктер, клиницистер, молекулалық биологтар, биоинформатиктер, деректер ғалымдары және бағдарламалық инженерлерден тұратын пәнаралық топ күрделі ауруларды зерттеуге көмектеседі. Жұмыс ауру механизмін анықтауға, диагностикалық болжамдарды басымдыққа бөлуге, биомаркерлерді табуға, емге жауапты бағалауға және жаңа терапиялық стратегияларды зерттеуге бағытталған. Есептеу нәтижесі диагнозды немесе дәрігер шешімін алмастырмайды; ол дәлелге негізделген шешімді қолдайды.

AlphaMissense зерттеуі адам протеомындағы ықтимал missense-нұсқалардың 89%-ын жіктегенін көрсетті. Бұл нәтиже ЖИ ауқымын көрсетеді, бірақ клиникалық қорытындыны маман мен пациент контексті негізінде растау қажет.1

1990–2003

Адам геномы жобасы халықаралық ынтымақтастық пен ашық геномдық деректер дәуірін қалыптастырды.2

~3 billion

адамның гаплоидты референстік геномындағы ДНҚ негіздерінің шамамен саны.3

~2%

адам геномында байқалған шамамен 4 миллион missense-нұсқаның клиникалық жіктелген үлесі; бұл интерпретациядағы үлкен алшақтықты көрсетеді.4

AI + expertise

DeepVariant секвенирлеу оқылымдарынан генетикалық нұсқаларды анықтау үшін терең оқытуды қолданудың тиімділігін көрсетті; клиникалық интерпретация әлі де маман сараптамасын қажет етеді.5

Әдебиеттер

  1. Cheng, J. et al. Accurate proteome-wide missense variant effect prediction with AlphaMissense. Science 381, eadg7492 (2023). https://doi.org/10.1126/science.adg7492.
  2. National Human Genome Research Institute. Human Genome Project (1990–2003). https://www.genome.gov/genetics-glossary/Human-Genome-Project.
  3. Nurk, S. et al. The complete sequence of a human genome. Science 376, 44–53 (2022). https://doi.org/10.1126/science.abj6987.
  4. Minton, K. Predicting variant pathogenicity with AlphaMissense. Nat. Rev. Genet. 24, 804 (2023). https://doi.org/10.1038/s41576-023-00668-9.
  5. Poplin, R. et al. A universal SNP and small-indel variant caller using deep neural networks. Nat. Biotechnol. 36, 983–987 (2018). https://doi.org/10.1038/nbt.4235.